Khi những di dân người Hán đầu tiên vượt biển đến khu vực Đài Loan, họ thấy quần đảo Bành Hồ cằn cỗi, chỉ có đảo Hoa là hơi có màu xanh nên gọi hòn đảo này là đảo Hoa, và gọi một hòn đảo khác gần đó là đảo Thảo[7]

Từ năm Khang Hy thứ 23 nhà Thanh (1684) đến thời Càn Long, đảo Hoa bị liệt vào cấm địa, nên mãi đến giữa thời Càn Long mới có người định cư trên đảo.[8] Tổ tiên của cư dân chủ yếu di cư từ thôn Thủy An và thôn Trung Xã trên đảo Vọng An.[7]

Đèn biển đảo Hoa được xây dựng vào năm 1939 trong kế hoạch quân sự của Nhật Bản trong khu vực.[9]

Sau khi chuyển giao Đài Loan cho Trung Hoa Dân Quốc vào năm 1945. Thôn Hoa Dữ được thành lập vào năm 1946.[2]

Cư dân trên đảo ban đầu sử dụng một giếng sâu để lấy nước. Theo thời gian, giếng bị cạn nước và một nhà máy khử mặn nước biển được xây dựng vào năm 2019. Vào ngày 11 tháng 8 năm 2019, nhà máy khử mặn này gặp sự cố khiến người dân khiếu nại. Nhà máy đã được khôi phục hoạt động bình thường vào ngày 20 tháng 8.[10]

Chiều ngày 5/10/2019, một tàu vô danh của Trung Quốc bị bắt quả tang vi phạm vùng biển Đài Loan 21 hải lý (39 km) về phía tây bắc đảo Hoa. Con tàu được đưa vào bờ và thủy thủ đoàn bị bắt.[11][12][13]